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生成英国地址的软件_英国地址生成_英国虚拟地址生成

截至目前,英国生物银行(UK Biobank)已处理并发布了超过 60 000 人的影像数据。应读者要求,本次推送介绍如何从RAP系统中直接下载UKB原始影像数据(UKB Imaging Data)。

Research Analysis Platform(简称RAP,地址:ukbiobank.dnanexus.com/)是UKB与AMS和DNAnexus合作推出的云计算平台,功能强大,是未来数据分析和计算的趋势。

【注意1】UKB影像数据下载使用前提:具备UKBTier 3数据权限(9000英镑档)。

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【注意2】UKB分配给每个所申请项目Project中的eid都是随机生成的,不同项目之间无法根据eid匹配!(否则大家都用一个Project不就行了,这个漏洞是肯定堵死的)。

【注意3】大宗影像数据的Bulk下载方法需要用到申请成功邮件里的MD5和ukbfetch等工具,网上已有教程请自行搜索。

【注意4】RAP使用前提:UK Biobank账号申请成功;Proposal申请成功;拥有AMS账号;数据使用费支付成功;数据使用协议签署成功。

【注意5】RAP有数据存储和使用费,但UKB直接release的raw data存储不收取费用,具体价格请查询:

【注意6】RAP注册和使用初级教程见:

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1、登录RAP系统英国地址生成,进入目标Project,点击进入Bulk文件夹,可以看到Brain MRI、Heart MRI、Whole Body DXA等影像数据均存放于此。

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2、本教程以提取Brain MRI影像数据为例,依次点击Brain MRI—>dMRI,可以看到许多以数字命名的子文件夹(这些数字据推测是eid的前2位):

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3、这里我随意的点击21号文件夹进去,可以看到许多zip压缩包,注意压缩包的命名格式是:7位数字_5位数字_1位数字_1位数字。

重点来了:开头的7位数字就是代表个体的eid,接下来的5位数字是Data Field ID,有了这个信息就可以直接下载影像数据进行匹配了!

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4、这里我随意的选择下载第一个zip包2115417_20218_2_0.zip,即在我Project中eid为2115417的参与者的大脑MRI影像数据(不要试图在你的Project中找这个eid,前面说了eid是UKB给每个项目随机生成的一套编码):

5、按照文件大小,下载138.84MB花费0.0054英镑(有没有路过的老板给报销下):

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6、这样2115417_20218_2_0.zip就成功下载到了本地电脑,解压后打开英国地址生成,发现包含600多个dcm文件(不要问我dcm文件怎么打开,你都用影像数据了肯定比我懂):

7、用影像软件打开,就可以看到图像和动画了:

就是这么简单,其他各个部位的影像数据下载方法也是大同小异,核心知识点就是zip文件名称里的第一组7位数字是eid。

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